医学院从1951年起先后开设各种医士类专业。1959年以来，先后举办五年制临床医疗大专班，中山医学院梅县分院临床医疗大专班。2003年起开办医学影像技术、公共卫生管理、口腔医学技术等全日制专科专业，2006年起开办全日制临床医学专科专业，2014年起开办全日制临床医学本科专业，2021年顺利通过教育部专业认证，是广东省一流本科专业建设点。

医学系现有临床医学本科专业在校学生约1200人，拥有一支实力较强、专业素质较高、结构合理的双师型师资队伍。内设临床技能中心，有技能实训室32间，面积3960平方米，实验开出率达到100%。

与省内10多家综合三级甲等综合医院、精神病专科医院、社区卫生服务中心等建立有稳定良好的教学实习基地。近年来医学系教师先后主持或参与省级市级教改、科研课题30多项，发表论文100多篇，主编或参编国家级规划教材10多部，20多位教师在省市专业学术团体任职。

临床医学专业实施整合模块课程教学，设置五大模块课程，19门整合课程。近5年来临床医学本科毕业生考研录取率逐年提高，毕业生参加全国执业医师考试通过率均超过当年全国平均水平。